绵羊KAP6基因家族四个新基因的鉴定
KAP6是一个高甘氨酸-酪氨酸角蛋白相关蛋白(HGT-KAP)家族。研究认为该家族包含多个基因。在这项研究中,研究人员利用KRTAP6编码序列搜索绵羊基因组(v3.1)并确定了五个同源区(R1-R5)。这些区域包含一个开放阅读框,他们的绵羊皮肤表达序列标签(EST)要么是相同的,要么是高度相似的。系统发育分析表明,不同物种KAP6序列的R1-R5进行聚类结果与其他HGT-KAPs不同。R1与KRTAP6-1序列的特征非常相似,但剩余的基因是新产生的。
通过设计PCR引物并扩增证实了这些新基因的存在。对所研究的96只绵羊全部进行了扩增。6、5、3和6的PCR-SSCP模式代表6、5、3和6的DNA序列分别在KRTAP6-2至KRTAP6-5基因中观察到。KRTAP6-2 和KRTAP6-4分别有5个和3个SNPs。KRTAP6-3中检测到3个SNPs和一个45bp的插入/缺失,KRTAP6-5中检测到5个SNPs和18bp的插入/缺失。美利奴羊和罗姆尼羊间这些KAP6基因的等位基因频率是不同的。